Deerhoof s'est formé en 1994 à San Francisco (Californie) sous l'impulsion de Rob Fisk (guitare) et Greg Saunier (batterie, claviers). Après l'arrivée de Satomi Matsuzaki (chant) en 1996, Deerhoof sort son premier album The Man, the King, the Girl (1997) sur le label Kill Rock Stars. Suit Holdy Paws (1999). Rob Fisk décide alors de quitter le groupe. Il est remplacé par John Dieterich (guitare). En 2001, Deerhoof livre son troisième opus Halfbird. Suivent Reveille (2002) et Apple O' (2003) qui lui confèrent une nouvelle notoriété. En 2004, Deerhoof signe Milk Man. L'année suivante, le groupe part en tournée aux Etats-Unis, en Europe et au Japon. Il sort dans la foulée The Runners Four (2005). En 2006, Deerhoof part en tournée avec The Flaming Lips, Mary Timony et The Fiery Furnaces. L'année suivante, il revient avec l'album Friend Opportunity. Suit Offend Maggie en 2008.